在后金入关之前，八旗之中的正黄旗、镶黄旗两旗，由大汗也就是后续的皇帝直接统领、全权掌控，是皇权直属嫡系力量，战力最强、待遇最优、地位最高。其余六旗，尽数由大汗的子侄、宗室权贵分别统领管辖，形成皇权嫡系与宗室分治的格局。

直至顺治八年，摄政王多尔衮病逝，顺治皇帝顺利亲政、收回大权，趁机将多尔衮常年掌控、势力庞大的正白旗尽数收回，划归皇帝直接统领。自此，镶黄、正黄、正白三旗归皇权直属，稳定形成了满清后世熟知的上三旗、下五旗格局，皇权集权力度大幅提升。