只是朱由崧并不相信后一种说法就是事情的真相，所以他冷然的命令道：“着东厂和锦衣卫速速查清三门和宁海境内可有异样！另外，立刻逮捕台州知府下狱，待事情查清楚后，再定其罪名！”

杨朋应声准备退下，却被朱由崧叫住了：“关于仙居百姓械斗一事，也是要厘清了的，既然乡民说仙居大理推事官官相护，那就让浙江巡按并浙江大理分寺一起去查办，勿枉勿纵，一切秉公执法，朕等着他们回报！”