天启年间的大明，虽然国力衰弱，但也不是荷兰人用几搜小型盖伦船和几百杂兵能征服的，所以，荷兰人尽管在澎湖坚持了两年多，但最终还是被明军击败和驱逐。

明白自己无力跟大明对抗的荷兰殖民者终于醒悟过来，便只能退而求其次的转向了台湾南部地区----有一种说法是，当时福建方面与荷兰人达成了在台湾南部贸易的秘密协定，所以荷兰人才把视线投向位于台窝湾的安平一线的。