麦克阿瑟下令战犯法庭的审判当中，不准涉及细菌武器问题，虽说当时麦克阿瑟收到了盟国要把天皇送上法庭的明确指示，仍不愿意审判天皇，他安排天皇到民间巡视，试图将其扮成接近人民的和平君主。

文件里也有当时麦克阿瑟列出的战犯名单，最后只有三百人被起诉，二十八人被判有罪，只有仅仅七人被处以死刑。

文件当中还提出被处决的日军军官大都是出身于长州的陆军将领，这也是对日本皇室的回报，长州人为主的陆军与以萨摩人为主的海军之间结怨很久，由于裕仁皇后良子的母亲就是萨摩藩藩主岛津的女儿，长州派首领的陆军元老山县有朋元帅就对裕仁的婚事横加反对，就造成与天皇结下了私怨。