支运是各地的粮草物资先就近运输，江西，江苏，湖广等地的物资由百姓运送到淮安。浙江直隶的官军再把物资转运到徐州，之后，京师近卫军负责把这些物资转移到山东德州，最后河南和山东的官军把粮食运输到通州一带，就完成了南粮北运。

朱棣为了鼓励农民参与漕运，下令规定道：“如果农民参与了运量，就不用再缴纳粮税。如果农民缴纳了粮税，就可以不参与运粮”。