在距今一千年前，当时云梦最强大的帝国亚特兰提斯，正因为急于扩张版图而与南方蛮族爆发历时长达百年的蛮荒之战，而这段历史，也是人族历史上所记载的最惨烈的百年战争。

千年石碑的故事就发生在这场战争之中，在当时南蛮被灭亡的一族中，有一名公主虽侥幸逃出，却也一路被亚特兰提斯的追兵一直追杀到龙族境域，而就在危急之时，突然出现的一名年轻旅者出手解救了这名任性公主的生命，更带着她突破亚特兰堤斯层层封锁，前往千里之外的曼特雷斯帝国。