叶枫的使命已经完结，宝可梦世界的神奥地区恢复了和平。

枪之柱空间被帝牙卢卡和帕路奇犽修复如初。

凤王和哲尔尼亚斯治愈了整个神奥地区的生命，然后飞走了，它们有属于自己的领地。

三湖神也恢复正常，为了感谢叶枫拯救了宝可梦世界，三湖神分别给了叶枫一个齿轮。

这三枚齿轮是时之齿轮，不过并不是本体，而是复刻版，拥有一次召唤三湖神之一的能力。