别看浙江民乱闹得沸沸扬扬、一度涉及到四十余县，但各路明军飞至沓来后，这些民变就跟如汤沃雪一般，很快被镇压了下去，最终在历时二个半月的弹压过程中，有大约六千名百姓伤亡并造成了大约一百七十万贯的经济损失。

朱由崧显然是不想承担这部分经济损失的，所以，他借机对涉嫌参与动乱的士绅进行了严厉的惩治，前后共抄没一百三十六家地主、十七家商贾、并流放了大约二万七千余人前往北地及海外；至于很难追查的东厂和锦衣卫两浙衙门及下属官员，朱由崧也给予了晋升一级，配海外诸王府为官、全家移民海外的处分，算是快刀斩乱麻的解决了问题。