洪武二十一年六月初，特进光禄大夫、左柱国、太师，韩国公李善长病逝，帝大悲，辍朝三日，赐葬钟山之阴，御制神道碑文，配享太庙，肖像功臣庙，谥号“文襄”。

洪武二十一年六月中，皇上认为锦衣卫有滥用职权，依势作宠之态，致使蒙冤枉死者不计其数，勒令刑部严查锦衣卫之暴行。

为追查罪责，皇上还特意超擢户部侍郎杨靖为正二品刑部尚书，负责主审锦衣卫滥用私刑、屈打成招一案，以严明律法。